Real-Time PCR Kitleri
Sepsis Paneli
Sepsis, genellikle bakteriyel, viral, protozoan veya mantar enfeksiyonlarının bir sonucu olarak bağışıklık sisteminin enflamatuvar yanıtının neden olduğu bir sendromdur. Sepsise neden olan primer enfeksiyon akciğerlerde, beyinde, idrar yollarında, deride veya karın bölgesinde görülebilir. Sepsis, erken tanı ve tedavi sağlanmadığı takdirde ağır sepsise, septik şok evrelerine ve bir veya birden fazla organın işlev bozukluğuna bağlı ölüme yol açabilir.
Sepsisin dünya çapında 30 milyondan fazla insanı etkilediği ve potansiyel olarak her yıl 6 milyon insanın ölümüne neden olduğu tahmin edilmektedir. Özellikle düşük ve orta gelirli ülkelerde anne ve yenidoğan hastalıklarının ve ölümlerinin ana nedeni olarak bilinmektedir.
Başlıca Özellikler
İş Akışı
Teknik Özellikler
| Termal Protokol | Tüm parametreler için tek termal protokol |
| Örnek Tipleri | Tam kan ve kan kültürü |
| Raf Ömrü | 18 Ay |
| Kanallar | FAM, HEX, Texas Red, Cy5 |
| Nakliye / Depolama | (-90°C)-(-20°C) / -20°C |
Sepsis Paneli Kitleri
Bosphore Sepsis Patojenleri Panel Kiti v1, tam kan ve kan kültürü örneklerindeki Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, Acinetobacter baumannii, Stenotrophomonas maltophilia, Pseudomonas aeruginosa, Candida albicans, Candida glabrata, Candida tropicalis, Aspergillus spp., koagülaz-negatif Staphylococcus (CoNS), Staphylococcus spp. ve Streptococcus spp. DNA’sını saptar ve ayırt eder. Floresans saptama FAM, HEX, Texas Red ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
PCR Master Mix 1 ile birinci tüpte; FAM kanalından Escherichia coli, HEX kanalından Staphylococcus aureus, Cy5 kanalından Enterococcus faecalis saptanır.
PCR Master Mix 2 ile ikinci tüpte; FAM kanalından Klebsiella pneumoniae, HEX kanalından Staphylococcus spp., Cy5 kanalından Enterococcus faecium saptanır.
PCR Master Mix 3 ile üçüncü tüpte; FAM kanalından Acinetobacter baumannii, HEX kanalından Stenotrophomonas maltophilia, Cy5 kanalından Pseudomonas aeruginosa saptanır.
PCR Master Mix 4 ile dördüncü tüpte; FAM kanalından Candida albicans, HEX kanalından Staphylococcus epidermidis, Cy5 kanalından Candida glabrata saptanır.
PCR Master Mix 5 ile beşinci tüpte; FAM kanalından Aspergillus spp., HEX kanalından Candida tropicalis, Cy5 kanalından Streptococcus spp. saptanır.
Kit, nükleik asit izolasyonu, PCR inhibisyonu ve aplikasyon hatalarını kontrol etmek için internal kontrol barındırmaktadır. DNA izolasyonu sırasında ya da PCR reaksiyon karışımına eklenebilen internal kontrolün amplifikasyon verisi, Texas Red filtresi kullanılarak görüntülenir.
Bosphore Sepsis Patojenleri Panel Kiti v2, tam kan ve kan kültürü örneklerindeki Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, Pseudomonas aeruginosa, Haemophilus influenzae (tip B), Neisseria meningitidis, Listeria monocytogenes, Salmonella enterica, Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus spp. ve Streptococcus spp. DNA’sını saptar ve ayırt eder. Floresans saptama FAM, HEX, Texas Red ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
Kit, nükleik asit izolasyonu, PCR inhibisyonu ve aplikasyon hatalarını kontrol etmek için internal kontrol barındırmaktadır. DNA izolasyonu sırasında ya da PCR reaksiyon karışımına eklenebilen internal kontrolün amplifikasyon verisi, Texas Red filtresi kullanılarak görüntülenir.
| FAM | HEX | Texas Red | Cy5 | |
| Tüp 1 | E. coli | S. aureus | Internal Kontrol | E. faecalis |
| Tüp 2 | K. pneumoniae | Staphylococcus spp. | Internal Kontrol | E. faecium |
| Tüp 3 | H. influenzae (tip B) | S. pneumoniae | Internal Kontrol | P. aeruginosa |
| Tüp 4 | X | N. meningitidis | Internal Kontrol | Streptococcus spp. |
| Tüp 5 | X | L. monocytogenes | Internal Kontrol | S. enterica |
Bosphore Sepsis Patojenleri Panel Kiti v3; 98/79/EC Talimatı uyarınca IVD-CE onaylı Real-Time PCR temeline dayanan tıbbi bir vücut-dışı tanı kitidir.
Bosphore Sepsis Patojenleri Panel Kiti v3, insan biyolojik örneklerindeki E. coli, Klebsiella pneumoniae, S. aureus, Staphylococcus epidermidis, Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, Acinetobacter baumannii, Stenotrophomonas maltophilia, Pseudomonas aeruginosa, Candida albicans, Candida glabrata, Candida tropicalis, Aspergillus spp., coagulase-negative Staphylococcus (CoNS), Staphylococcus spp., Streptococcus spp., Haemophilus influenzae (tip B), Listeria monocytogenes, Salmonella enterica ve Streptococcus pneumoniae DNA’sını saptar ve ayırt eder. Floresans saptama, FAM, HEX, Texas Red ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
Kit, nükleik asit izolasyonu ve PCR inhibisyonunu kontrol etmek için internal kontrol barındırmaktadır. İzolasyon sırasında PCR reaksiyon karışımına eklenebilen internal kontrolün amplifikasyon verisi, Texas Red filtresi kullanılarak görüntülenir.
| FAM | HEX | Texas Red | Cy5 | |
| Tüp 1 | E. coli | S. aureus | Internal Kontrol | E. faecalis |
| Tüp 2 | K. pneumoniae | Staphylococcus spp. | Internal Kontrol | E. faecium |
| Tüp 3 | A. baumannii | S. maltophilia | Internal Kontrol | P. aeruginosa |
| Tüp 4 | C. albicans | S. epidermidis | Internal Kontrol | C. glabrata |
| Tüp 5 | Aspergillus spp. | C. tropicalis | Internal Kontrol | Streptococcus spp. |
| Tüp 6 | H. influenzae (tip B) | S. pneumoniae | Internal Kontrol | X |
| Tüp 7 | X | L. monocytogenes | Internal Kontrol | S. enterica |
Bosphore Sepsis Panel Bundle Kiti , 32 farklı patojeni ve en yaygın 10 antimikrobiyal direnç genini saptamak ve karakterize etmek için tasarlanmış bir Real-Time PCR kitidir.
Kit, Bosphore Sepsis Tarama Kiti (Kutu 1) ve Bosphore ABR Tarama Kiti (Kutu 2) kombinasyonundan oluşur.
Bosphore Sepsis Tarama Kitinin (Kutu 1) hedef patojenleri;
- A. baumannii, Campylobacter spp, E. aerogenes, E. cloacae, E. coli, H. influenzae type b, K. oxytoca, K. pneumoniae, N. meningitidis, P. aeruginosa, P. mirabilis, S. enterica, S. maltophilia, S. marcescens türü Gram(-) bakterileri,
- E. faecalis, E. faecium, L. monocytogenes, Staphylococcus spp., S. aureus, S. epidermidis, Streptococcus spp., S. agalactiae, S. pneumoniae, S. pyogenes türü Gram(+) bakterileri ve
- Aspergillus spp., C. albicans, C. glabrata, C. krusei, C. auris, C. tropicalis, C. parapsilosis, Fusarium spp. türü mantarlardır.
Bosphore ABR Tarama Kitinin (Kutu 2) hedeflediği direnç genleri ise şunlardır: OXA-48, KPC, NDM, VIM, IMP (karbapenem direnci genleri), vanA, vanB (vankomisin direnci genleri), MCR-1 (kolistin direnci), mecA (+)(metisilin direnci) ve son olarak ESBL CTX-M (ß-laktam direnci).
FAM, HEX, Texas Red ve Cy5 filtreleri kullanılarak floresans tespiti yapılır. İnternal kontrol ve pozitif kontroller kite entegre edilmiştir.
Bosphore ABR Tarama Kiti, insan tam kan örneklerinde Yeni Delhi metallo-beta-laktamaz (NDM), oksasilinaz-48 benzeri (OXA 48), K. pneumoniae karbapenemaz (KPC), imipenemaz (IMP), verona integronuna bağlı metallo-beta-laktamaz (VIM), sefotaksimaz (CTX-M), mobilize kolistin direnci-1 (MCR-1), vankomisin direnci A (Van A), vankomisin direnci B (Van B) ve metisilin direnç geni (mecA) direnç genlerini tespit etmek ve karakterize etmek için tasarlanmış bir Real-Time PCR kitidir. Floresans tespiti FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| FAM | HEX | Texas RED | Cy5 | |
| PCR Master Mix 1 | NDM | OXA 48 | – | KPC |
| PCR Master Mix 2 | IMP | VIM | CTX-M | MCR-1 |
| PCR Master Mix 3 | Van A | Van B | mecA | İnternal Kontrol |
Kit, nükleik asit izolasyonu, PCR inhibisyonu ve aplikasyon hatalarını kontrol etmek için internal kontrol barındırmaktadır. DNA izolasyonu sırasında ya da PCR reaksiyon karışımına eklenebilen internal kontrolün amplifikasyon verisi, PCR Master Mix 3’teki Cy5 filtresi kullanılarak görüntülenir. İnternal kontrol, DNA izolasyonu veya PCR adımı sırasında eklenebilir.
Bosphore Sepsis Tarama Kiti, 32 farklı patojeni saptamak ve karakterize etmek için tasarlanmış bir Real-Time PCR kitidir.
Bosphore Sepsis Tarama Kitinin hedef patojenleri;
- Gram(-)A. baumannii, Campylobacter spp, E. aerogenes, E. cloacae, E. coli, H. influenzae (type b), K. oxytoca, K. pneumoniae, N. meningitidis, P. aeruginosa, P. mirabilis, S. enterica, S. maltophilia, S. marcescens türü Gram(-) bakterileri,
- Gram(+) E. faecalis, E. faecium, L. monocytogenes, Staphylococcus spp., S. aureus, S. epidermidis, Streptococcus spp., S. agalactiae, S. pneumoniae, S. pyogenes türü Gram(+) bakterileri ve
- Fungi Aspergillus spp., C. albicans, C. glabrata, C. krusei, C. auris, C. tropicalis, C. parapsilosis, Fusarium spp. türü mantarlardır.
FAM, HEX, Texas Red ve Cy5 filtreleri kullanılarak floresans tespiti yapılır.
| Component | FAM | HEX | Texas RED | Cy5 |
| PCR Master Mix 1 | S. agalactiae | S. aureus | S. pneumoniae | E. faecalis |
| PCR Master Mix 2 | K. pneumoniae | Staphylococcus spp. | S. marcescens | E. faecium |
| PCR Master Mix 3 | A. baumannii | S. maltophilia | C. krusei | P. aeruginosa |
| PCR Master Mix 4 | C. albicans | S. epidermidis | E. cloacae | C. glabrata |
| PCR Master Mix 5 | Aspergillus spp. | C. tropicalis | E. coli | Streptococcus spp. |
| PCR Master Mix 6 | H. influenzae (type B) | L. monocytogenes | C. parapsilosis | S. enterica |
| PCR Master Mix 7 | K. oxytoca | P. mirabilis | E. (Klebsiella) aerogenes | N. meningitidis |
| PCR Master Mix 8 | Fusarium spp. | Campylobacter spp. | C. auris | İnternal Kontrol |
| PCR Master Mix 9 | X | X | S. pyogenes | İnternal Kontrol |
İnternal kontrol, DNA izolasyonunu, PCR inhibisyonunu veya uygulama sorunlarını kontrol etmek için kite entegre edilmiştir. İnternal kontrolün amplifikasyon verileri sadece PCR Master Mix 8 ve 9 için Cy5 filtresi ile tespit edilir. İnternal kontrol, DNA izolasyonu veya PCR adımı sırasında eklenebilir.
